Biopython Nedir?

Yorum bırakın

12/10/2013 tarafından electrocoder

biopython.jpeg

      Biopython biyolojik hesaplamaların yapılması amacıyla, uluslararası geliştiriciler tarafından

python

      programlama dili ile geliştirilmiş ücretsiz bir yazılımdır.
      Biyoinformatik hesaplamaların gelecekteki ihtiyaçlarıda göz önüne alınarak geliştirilen biopython açık kaynaklı ve basit bir lisans anlaşması ile kamuya duyurulmuştur. Lisans anlaşmasını okumak için

buraya 

      bakabilirsiniz.

Biopython’ un resmi wiki sitesine buradan 

      ulaşabilirsiniz.
      Biopython kurulum yardımı için

Google Docs 

      üzerindeki dökümanı okuyabilirsiniz.
      BioPython python’ un 2.5 – 2.6 ve 2.7 sürümlerinde çalışmaktadır. Sisteminizde pythonun bu sürümleri veya daha farklı bir sürümü varsa yükleme talimatlarını dikkatlice okumalısınız. Python kurulu değil ise

Download 

      sayfamızdan pythonu kurunuz.
      BioPython Unix/Windows/Mac OS X kurulumu:

 

      ———————————–

 

NumPy kütüphanesini
http://numpy.scipy.org/.

 

      adresinden indirip kurunuz.

http://www.egenix.com/products/python/mxBase/mxTextTools/

      adresinden mxTextTools kütüphanesini indirip kurunuz.

http://biopython.org/wiki/Download

       adresinden biopython kütüphanesini indirip kurunuz.
python setup.py install

 

      komutunu çalıştırınız. Bir hata ile karşılaşırsanız işlemleri tekrar gözden geçirin.
      Biopythonu Python paket indexi ile kurmak isterseniz

 

easy_install -f http://biopython.org/DIST/ biopython

 

      komutunu çalıştırınız.
      Sistem üzerinde yönetici ayrıcalıklarına sahip degilseniz

 

sudo easy_install -f http://biopython.org/DIST/ biopython

 

      komutunu kullanmayı unutmayın.
      Soru ve örnekler için sonraki makalede buluşmak üzere…
Reklamlar

Bir Cevap Yazın

Aşağıya bilgilerinizi girin veya oturum açmak için bir simgeye tıklayın:

WordPress.com Logosu

WordPress.com hesabınızı kullanarak yorum yapıyorsunuz. Çıkış  Yap / Değiştir )

Twitter resmi

Twitter hesabınızı kullanarak yorum yapıyorsunuz. Çıkış  Yap / Değiştir )

Facebook fotoğrafı

Facebook hesabınızı kullanarak yorum yapıyorsunuz. Çıkış  Yap / Değiştir )

Google+ fotoğrafı

Google+ hesabınızı kullanarak yorum yapıyorsunuz. Çıkış  Yap / Değiştir )

Connecting to %s

%d blogcu bunu beğendi: